Per línia de recerca s’entén una especialitat o camp de recerca fonamental en Arqueologia Clàssica. S’hi integren programes i projectes promoguts pel mateix ICAC i per les universitats, institucions i grups de recerca amb els quals se signin convenis de col·laboració.
Les línies de recerca en les què s’estructura actualment la recerca de l’ICAC són les següents:
Arqueologia de la ciutat antiga
Arqueologia del paisatge, poblament i territori
